W wyniku niektórych sytuacji przedsiębiorca ma obowiązek dokonania korekty podatku naliczonego, co następuje np. przy rezygnacji ze zwolnienia z podatku VAT bądź w przypadku zmiany sposobu wykorzystywania pojazdów będących firmowymi środkami trwałymi.
Wartość korekty podatku VAT należy wyliczyć samodzielnie poza systemem. Następnie, aby uwzględnić korektę podatku VAT naliczonego od nabyć środków trwałych bezpośrednio w deklaracji VAT, należy przejść do zakładki: EWIDENCJE » REJESTR VAT ZAKUPÓW » DODAJ WPIS, zaznaczyć opcje BRAK KONTRAHENTA, a następnie w zakładce ZAAWANSOWANE zaznaczyć opcję KOREKTA PODATKU NALICZONEGO OD NABYĆ ŚRODKÓW TRWAŁYCH oraz wprowadzić kwotę korekty (na plus lub na minus) w polu PODATEK NALICZONY. Dodatkowo, gdy korekta dotyczy wycofania towarów na cele osobiste czy rocznej korekty podatku naliczonego w przypadku prowadzenia sprzedaży mieszanej, należy zaznaczyć opcję WEW.
Podczas generowania pliku JPK_V7M/V7K, kwota korekty zostanie wykazana w poz. 44 "Korekta podatku naliczonego, o których mowa w art. 90a-90c oraz art. 91 ustawy, z tytułu nabycia towarów i usług zaliczanych u podatnika do środków trwałych".
Wartość wyliczonej korekty podatku naliczonego od nabyć środków trwałych stanowi koszt uzyskania przychodu, który należy ująć w KPiR na podstawie dowodu wewnętrznego w zależności od rodzaju korekty:
korekta podatku naliczonego in minus - należy wystawić DW dokumentujący wydatek przez zakładkę WYDATKI » KSIĘGOWANIE » DODAJ » DOWÓD WEWNĘTRZNY, gdzie jako SCHEMAT KSIĘGOWY należy ustawić KOSZTY PROWADZENIA DZIAŁALNOŚCI. Wystawiony w ten sposób dowód wewnętrzny będzie ujęty w kolumnie 13 KPiR - Pozostałe wydatki.